مدیریت پیشگیری و مبارزه با بیماریها بر این امر اهتمام دارد که کیفیت فنی خدمات را به صورتی برنامه ریزی نماید که خدمات قابل ارایه موثر واقع شود. کابرد آن بی خطر و دارای تاثیر پایدار بوده و همچنین جامعه قادر به پرداخت هزینه های آن باشد. بررسی اپیدمیولوژیک بیماریهای  واگیر و غیرواگیر را به نحو موثر انجام دهد و با پایش دائمی وضعیت بیماریها در جامعه وضعیت بیماریهای بازپدید و نوپدید را مد نظر داشته باشد همچنین مدیریت ارائه خدمات بیماریهارا با انجام فعالیت های موثر در سطوح برنامه ریزی ، سازمان دهی ، پایش و ارزشیابی ، هدایت و رهبری ، هماهنگی های برون بخشی و درون بخشی ( ارتباط سازمانی ) تصمیم گیری ، خلاقیت و نوآوری و نیز جلب مشارکت جامعه برای دستیابی به یک پوشش مطلوب را به نحو مطلوب به انجام رساند. .
خدماتی که گروه پیشگیری و مبارزه با بیماریها ارائه می دهد به طور خلاصه به شرح زیر است :
-مطالعه و شناخت وضعیت اپیدمیولوژیک بیماریها در سطح استان ، کشور و دنیا
-نظارت ، پایش و ارزشیابی برنامه های کنترل بیماریها در سطح استان
-مراقبت و کنترل اپیدمی ها
-تسهیل زمینه های اجرایی برنامه های کشوری تدوین شده در زمینه کنترل بیماریها
-جلب و ایجاد همکاری درون و برون بخشی
-برنامه ریزی و همکاری در انجام برنامه های آموزشی همگانی و آموزش کارکنان بهداشت و درمان
-برنامه ریزی و انجام سمینارها و کارگاه های آموزشی
-انجام و مشارکت در مطالعات پژوهشی و تحقیقاتی
-تهیه و توزیع رسانه های مختلف خبری و آموزشی
رسالت :
پیشگیری و کنترل بیماریهای واگیر بمنظور دستیابی به اهداف تعیین شده در سیستم سورویلانس هرکدام از این بیماریها
بیانیه ماموریت:
گروه مبارزه با بیماریها برآنست که با اجرای نظام مراقبت طراحی شده برای بیماریهای گروه هدف از بار این بیماریها در جامعه بکاهد و بر حسب مورد به سمت ریشه کنی ، حذف و کنترل این بیماریها قدم بردارد .
علاوه براین مقابله با طغیان بیماریها و پیش بینی بروز مشکلات واگیر ( بر اساس اطلاعات و مکانیسم های موجود ) از اولویتهای ماموریت ما می باشد.