امور آزمایشگاهها فعالیت خود را از سال 1386 آغاز نمود . تعداد30 آزمایشگاه بهداشتی را تحت پوشش دارد. هدف اصلی ارتقاء کیفیت خدمات آزمایشگاهی میباشد.

• بازبینی 10%لام های منفی سل و تمام لام های مثبت سل ارسالی از آزمایشگاههای استان
• بازبینی 10%لام های منفی مالاریا و تمام لام های مثبت مالاریای ارسالی از آزمایشگاههای استان
• تأیید و انجام آزمایشات تکمیلی موارد ارسالی مشکوک به التور از آزمایشگاههای بهداشتی
• تهیه و توزیع محیط های نمونه گیری آنفلوانزا ، سیاه سرفه ، دیفتری ، سرخک بین مراکز بهداشتی
• همکاری در اجرای طرح های نظام مراقبت بیماریهای غیرواگیر ، نظام مراقبت دانش آموزان و پایش ید ادرار
• پایش آزمایشگاههای مراکز بهداشتی و رتبه بندی آن اجرای ممیزی و پایش آزمایشگاههای بهداشتی
• استقرار سیستم مدیریت کیفیت در آزمایشگاههای تحت نظر
• مشارکت در کمیته های تخصصی نظارت بر اجرای برنامه کنترل کیفی خارجی
• برگزاری کارگاههای آموزشی تخصصی جهت کارکنان آزمایشگاههای بهداشتی
• ارسال آخرین دستورالعمل ها و بخشنامه ها از آزمایشگاه مرجع سلامت به آزمایشگاههای بهداشتی
• تجهیز و راه اندازی واحد های آزمایشگاهی.
• ارتقاء کیفیت خدمات آزمایشگاهی.
• همکاری با اداره امور آزمایشگاهها در زمینه های لازم